58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3029 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  100 
 
 		 367 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  46.03 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  45.4 
 
 		 349 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  43.25 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  39.3 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  43.52 
 
 		 525 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  38.59 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  36.39 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  38.24 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 497 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  30.77 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  32.51 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  30.3 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  34.16 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.78 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  28.34 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  28.07 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  23.64 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  29.02 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  26.3 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  27.94 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  24.8 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  27.94 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  26.77 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  28.25 
 
 		 274 aa  93.2  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  26.5 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  27.07 
 
 		 291 aa  86.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.52 
 
 		 593 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  25.23 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  25.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  25.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.26 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.92 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1970  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  22.87 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.750902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  24.8 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0482477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.84 
 
 		 611 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  21.89 
 
 		 544 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  24.29 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  23.36 
 
 		 652 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  22.03 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  22.97 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3115  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.37 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  22.45 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0645  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  25.67 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  31.86 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1058  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.32 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1696  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.96 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1183  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  31.31 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  19.76 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  20.1 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1495  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  38.81 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>