70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3269 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
574 aa  1185    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  60 
 
 
568 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  60 
 
 
568 aa  695    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.56 
 
 
593 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.15 
 
 
611 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.88 
 
 
243 aa  103  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  31.22 
 
 
242 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.4 
 
 
241 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  26.48 
 
 
675 aa  87.4  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.28 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  23.97 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.55 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.72 
 
 
245 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.47 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.54 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  27.17 
 
 
244 aa  67  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.65 
 
 
453 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.63 
 
 
256 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.62 
 
 
264 aa  61.6  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.89 
 
 
237 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.29 
 
 
266 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.18 
 
 
234 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.02 
 
 
239 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  35.34 
 
 
282 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1599  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.3 
 
 
251 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.2 
 
 
212 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.23 
 
 
225 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  24.64 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.16 
 
 
234 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.37 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0376  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.34 
 
 
258 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2614  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.36 
 
 
252 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.06 
 
 
224 aa  52.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  21.26 
 
 
324 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.13 
 
 
248 aa  51.6  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4306  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.47 
 
 
242 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.39 
 
 
241 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.12 
 
 
242 aa  50.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2047  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.5 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4175  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.09 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4328  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.69 
 
 
242 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
228 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.83 
 
 
241 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0038  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
306 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0169  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
249 aa  47.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.719542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.91 
 
 
227 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1236  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.58 
 
 
243 aa  47.4  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1900  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.79 
 
 
256 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0017  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
249 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1728  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.67 
 
 
252 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1613  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.64 
 
 
245 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0807949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0038  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.538972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18930  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.73 
 
 
241 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2642  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.92 
 
 
256 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.1 
 
 
245 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7057  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.99 
 
 
246 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3687  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.46 
 
 
257 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.73 
 
 
231 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.48 
 
 
244 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2800  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  29.23 
 
 
252 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0968  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.46 
 
 
248 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0430  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.75 
 
 
255 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  28.57 
 
 
682 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  24.32 
 
 
246 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3649  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.86 
 
 
247 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0946997  normal  0.15995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1984  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.72 
 
 
245 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000339206  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2375  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.72 
 
 
245 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000365007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2363  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.72 
 
 
245 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.72 
 
 
245 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000979524  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>