63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2209 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  55.75 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  54.5 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.81 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.63 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.56 
 
 		 453 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  33.95 
 
 		 675 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.32 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.29 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  31.88 
 
 		 682 aa  99  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.01 
 
 		 593 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.66 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.61 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.32 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.76 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 288 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.5 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.64 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.78 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.25 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  30.49 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.92 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  29.33 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.72 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.37 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.93 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.36 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.41 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  30.52 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.01 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.65 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.23 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  26.87 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  27.96 
 
 		 876 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  31.86 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 574 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0437  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F CMP-KDO synthetase-like protein  24.31 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  28.85 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  30.63 
 
 		 574 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2047  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 568 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 568 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  22.9 
 
 		 468 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0807949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1375  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  25.4 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.17 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000481379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0903  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35.24 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0286516  normal  0.514763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0430  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1275  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.07 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000078391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0727  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.97 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5734  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4894  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.93 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0903  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.89 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.327197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1728  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.95 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1613  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.19 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4200  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.12 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2639  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>