47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0645 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  85.48 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.48 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.62 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  39.5 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.47 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.77 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.54 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.31 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  37.55 
 
 		 675 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  32.9 
 
 		 682 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.19 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.71 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.4 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.39 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  34.27 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.42 
 
 		 593 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.1 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.17 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 453 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.7 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.46 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.52 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.65 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  27.31 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.46 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.37 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  27.36 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.68 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  25.68 
 
 		 282 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  28.92 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.1 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.23 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.7 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.99 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.23 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  29.01 
 
 		 611 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  27.03 
 
 		 876 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 574 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  22.83 
 
 		 574 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0437  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F CMP-KDO synthetase-like protein  26.24 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0149  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.28 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000175858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>