85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  100 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.93 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.03 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  32.07 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.48 
 
 		 593 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.43 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  27.23 
 
 		 324 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.95 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.27 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 453 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.14 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.16 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.82 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  27.08 
 
 		 675 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.64 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.09 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  29.55 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.17 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.21 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.59 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.32 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  36.89 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  28.57 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.86 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.93 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0149  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.49 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000175858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  23.39 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  36.63 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.23 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.08 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.6 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.71 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  26.16 
 
 		 876 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.71 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  25.21 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0209  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  22.56 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  28.29 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.58 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  44.68 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00561712  normal  0.0137195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0180  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  44.68 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.532652  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.37 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.37 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25531  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  38.3 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.32 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2058  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.72 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.307895 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1375  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  27.34 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1856  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  24.67 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000400119  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1985  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00836989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1719  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.25 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2424  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.33 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000116864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2800  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  40 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2044  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.35 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1772  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  21.62 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1783  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.42 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1275  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.24 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000078391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2951  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.84 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.839592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.56 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1896  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.24 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.32 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000481379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.68 
 
 		 400 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0027  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  26.23 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2205  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.75 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0749  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.1 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.304533  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3222  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.18 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2182  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.56 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000335618  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0320  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.71 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2547  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0596  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.16 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1759  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.56 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5878  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2465  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1935  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2571  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.326733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0310  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.26 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1866  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.16 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2595  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  51.43 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0944076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1599  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0282  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.73 
 
 		 254 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5048  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  34 
 
 		 247 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>