57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0776 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  42.13 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  44.23 
 
 		 264 aa  175  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  40 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  45.88 
 
 		 267 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  42.27 
 
 		 675 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.04 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.56 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.1 
 
 		 288 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.07 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.31 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.27 
 
 		 241 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  34.11 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.13 
 
 		 261 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.66 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.34 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  32.38 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.08 
 
 		 593 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  29.13 
 
 		 682 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.92 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.05 
 
 		 250 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.09 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.48 
 
 		 611 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  28.02 
 
 		 611 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 453 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.22 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  28.12 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.41 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.68 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.55 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0437  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F CMP-KDO synthetase-like protein  27.8 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  24.12 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.67 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  27.38 
 
 		 876 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.58 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  26.2 
 
 		 574 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  23.64 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1866  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1728  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.63 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1275  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.87 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000078391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1613  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.66 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0149  acylneuraminate cytidylyltransferase  23 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000175858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1896  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 574 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2614  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1599  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2414  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.27 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2038  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.61 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2980  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.52 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2639  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.63 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>