44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0437 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0437  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F CMP-KDO synthetase-like protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.12 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  31.16 
 
 		 267 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.44 
 
 		 256 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.25 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  26.92 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.5 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.8 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.32 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.91 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.89 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.44 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  29.06 
 
 		 682 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.21 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.05 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  25.44 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.22 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.24 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.5 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.31 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.91 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.86 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.31 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.62 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.97 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000481379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.81 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.25 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.11 
 
 		 453 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.88 
 
 		 593 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.96 
 
 		 611 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  27.08 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1759  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.42 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.89 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  25 
 
 		 568 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  24.59 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0807949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.88 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.37 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0160817  unclonable  0.0000196701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1851  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.37 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000189407  hitchhiker  0.000000640943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1906  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.37 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007413  unclonable  0.0000000000750145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.37 
 
 		 245 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2424  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.55 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000116864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>