88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0248 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.45 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.39 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.72 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.86 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  34.74 
 
 		 675 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.76 
 
 		 593 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  32.06 
 
 		 876 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.47 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.76 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.58 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  31.36 
 
 		 682 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.36 
 
 		 611 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.22 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.06 
 
 		 453 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.44 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.46 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.86 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  31.19 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  30.62 
 
 		 324 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.64 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  28.64 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.78 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.28 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  30 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.17 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  31.71 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.34 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.94 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.27 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  25.44 
 
 		 611 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  30 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.77 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  33.01 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0320  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.5 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5734  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.8 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 574 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 574 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1275  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.18 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000078391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1613  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3909  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 428 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.790308 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4306  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1866  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.02 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1728  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1896  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.68 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0968  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4328  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4175  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1375  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  24.8 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.5 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.02 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0807949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2614  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.44 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0430  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.21 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.58 
 
 		 568 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0339  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.64 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.129985  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2038  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.73 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4319  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  24.14 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2079  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.93 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.58 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3222  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.23 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.44 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000481379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2582  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1599  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.61 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2980  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.61 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.41 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.84 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2414  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.61 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1064  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.91 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2951  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  29.75 
 
 		 271 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.839592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.89 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0160817  unclonable  0.0000196701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1851  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.89 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000189407  hitchhiker  0.000000640943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1906  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.89 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007413  unclonable  0.0000000000750145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1393  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.83 
 
 		 275 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1965  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.82 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.583633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2065  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2571  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.82 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2660  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.82 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.89 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1759  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.44 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183972  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0310  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>