More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2166 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2166  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 312 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4139  pyridoxal-phosphate dependent protein  66.67 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0110645  normal  0.0292289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4087  pyridoxal-phosphate dependent protein  66.67 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0413  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.65 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0075  pyridoxal-phosphate dependent protein  73.83 
 
 		 107 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.560403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  35.57 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  35 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  31.56 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  31.91 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  31.86 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  32.11 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  35.45 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  33.11 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  31.77 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.88 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  33.22 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  31.77 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  30.26 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  31.23 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  34.97 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  31.67 
 
 		 307 aa  143  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  32.32 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  32.32 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.14 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  33 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.14 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  32.14 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  30.82 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  30.77 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  29.24 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  33.44 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  29.87 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  33.11 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.1 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  29.55 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  28.9 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  33.78 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0269  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.6 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  29.9 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  31.6 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  30.69 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  30.7 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  29.37 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  33.11 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  30.67 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  32.36 
 
 		 300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  32.36 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  29.37 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  30.64 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  32.78 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  31.49 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  29.51 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  32.32 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.74 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.74 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  30.19 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.12 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  30.2 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  30.19 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  29.57 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  29.8 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  29.28 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  31.8 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  32.78 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  29.61 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  29.91 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  27.92 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  31.43 
 
 		 387 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  30.79 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  29.55 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  30.16 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  30.77 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  32.12 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  32.12 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  32.12 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  32.12 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  32.12 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.64 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.12 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  30.42 
 
 		 459 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  30.16 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  31.8 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  32.67 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.83 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  30.13 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  30.2 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  28.9 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  28.71 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  31.79 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.83 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.84 
 
 		 459 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  31.79 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0642  cysteine synthase  31.13 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1882  cysteine synthases  34.11 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  29.1 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  31.79 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>