More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4139 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4087  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 314 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4139  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 314 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0110645  normal  0.0292289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2166  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.67 
 
 		 312 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0413  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.47 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0075  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 107 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.560403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  35.33 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  34.21 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  32 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  32.33 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  32.33 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  31.33 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  32.33 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  32.67 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  33.89 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.88 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  33.89 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  34.22 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  32.33 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  31.15 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  31.68 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  33.22 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  33.55 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  27.57 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  29.87 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  32.03 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.88 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  29.22 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  36.27 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  34.22 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  31.56 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  32.14 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  28.9 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  33.77 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  29.87 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  30.03 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  31 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  31.56 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  30.23 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  29.51 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  31.15 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0269  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.27 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  32.89 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  30.45 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  30.46 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  29.97 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  32.12 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  30.84 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  32.78 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  32.67 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  29.28 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  30.16 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  31.49 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  31.67 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  28.57 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  29.32 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  28.66 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  29.84 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  28.86 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  31.13 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  30.1 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  28.85 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  30.69 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  30.39 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  28.86 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  29.43 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  30.59 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  28.57 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  30.59 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  29.11 
 
 		 459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  30.26 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  32.69 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  31.34 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  32.7 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  29.67 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.11 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  29.58 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  28.12 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  28.48 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.11 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  31.05 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  28.76 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  28.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  28.09 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  31.39 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  31.72 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  29.08 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  29.22 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  29.87 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  30.59 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  27.81 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  28.76 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  27.8 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  29.93 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  29.08 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  31.39 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>