153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0979 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  91.14 
 
 		 474 aa  919    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 474 aa  994    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.65 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.81 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.38 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 430 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  33.42 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  33.17 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.78 
 
 		 413 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  31.78 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.28 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.25 
 
 		 416 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.28 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.76 
 
 		 437 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  30.84 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.5 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.38 
 
 		 456 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  28.92 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  27.84 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  26.38 
 
 		 1053 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  24.07 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 		 287 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  31.11 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  29.68 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  30.14 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  29.22 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  28.87 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  25.48 
 
 		 1264 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.38 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.13 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  20.42 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  26.79 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  30.52 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  28.11 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  26.89 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  28.23 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  28.45 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 289 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  25 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  23.79 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  26.61 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  25.62 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  23.79 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  34.48 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  26.73 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  28.26 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  30.37 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  27.02 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  23.75 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  29.63 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  25.35 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  28.19 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  25.79 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  27.7 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  24.1 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  29.36 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  26.32 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  24.91 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  25.1 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  27.09 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  28.37 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  23.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  28.03 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  27.96 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  32.74 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 284 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  26.7 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  24.11 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  28.5 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  25.99 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>