176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1772 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  100 
 
 
392 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  32.64 
 
 
397 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  30.13 
 
 
430 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0399088 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  31.69 
 
 
1053 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  32.21 
 
 
436 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.3 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  28.62 
 
 
1064 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  31.08 
 
 
261 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.23 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.48 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  28.73 
 
 
294 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  27.84 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  25.58 
 
 
259 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  31.02 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.4 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.22 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.64 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.09 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.99 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  26.47 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  29.15 
 
 
1264 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.68 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  26.73 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.84 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  28.31 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.43 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.43 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  26.47 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.41 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.87 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
286 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  27.87 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.98 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.89 
 
 
610 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  25.61 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  29.36 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  26.02 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.56 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  27.38 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 
613 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  27.43 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  27 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  27 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  27 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  27 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  29.82 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  25.34 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  28.03 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  30.09 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  29.82 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  25 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  28.37 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  27.88 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  26.32 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  25.81 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  27.49 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  26.25 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  27.49 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>