184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04930 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  851    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  38.14 
 
 
1064 aa  249  9e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  44.41 
 
 
1264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  42.44 
 
 
1053 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  32.55 
 
 
347 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  38.31 
 
 
301 aa  158  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  33.79 
 
 
294 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  36.03 
 
 
306 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  35.46 
 
 
294 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.08 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 
298 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  31.82 
 
 
286 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
292 aa  113  5e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  31.89 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  31.89 
 
 
285 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 
284 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  31.33 
 
 
285 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.48 
 
 
415 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.48 
 
 
415 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  29.67 
 
 
306 aa  106  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
286 aa  106  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  30.34 
 
 
288 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
303 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  25.98 
 
 
283 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  25.98 
 
 
283 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  31.36 
 
 
282 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
286 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  31.36 
 
 
282 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  31.87 
 
 
277 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  31.4 
 
 
293 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 
610 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 
280 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  29.1 
 
 
286 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
433 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.31 
 
 
413 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  29.53 
 
 
286 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
433 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
433 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
433 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 
613 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  30.83 
 
 
277 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
433 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  30.99 
 
 
283 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  32.84 
 
 
433 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.01 
 
 
416 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.01 
 
 
437 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.54 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.01 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  28.81 
 
 
283 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  29.53 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30.13 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  30.04 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  28.25 
 
 
286 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 
322 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  30.29 
 
 
287 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  29.57 
 
 
287 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  29.83 
 
 
293 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  29.83 
 
 
293 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  29.83 
 
 
293 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  26.79 
 
 
282 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  29.59 
 
 
342 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  28.33 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  25.6 
 
 
284 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  29.34 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  28.87 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 
285 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  28.27 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  28.15 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
289 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 
287 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  29.61 
 
 
287 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
259 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  29.54 
 
 
304 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  25.51 
 
 
280 aa  93.2  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 
292 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  27.74 
 
 
316 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  28.4 
 
 
292 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  28.35 
 
 
292 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  28.35 
 
 
292 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>