175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3176 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  98.57 
 
 
433 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  99.74 
 
 
433 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  98.57 
 
 
433 aa  822    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  98.57 
 
 
433 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
430 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
433 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  98.57 
 
 
433 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.02 
 
 
416 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.81 
 
 
437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.56 
 
 
437 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.56 
 
 
416 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.14 
 
 
415 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.14 
 
 
415 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  64.91 
 
 
416 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  66.09 
 
 
413 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  43.85 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.56 
 
 
456 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  39.14 
 
 
446 aa  289  9e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  40.45 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  36.92 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.43 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.33 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  30 
 
 
417 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  58.27 
 
 
159 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  32.34 
 
 
1264 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  29.76 
 
 
1053 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 
409 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  33.5 
 
 
301 aa  99.8  9e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  31.71 
 
 
1064 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  28.57 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
406 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  31.2 
 
 
347 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  32.35 
 
 
306 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.48 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.51 
 
 
294 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  24.45 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.18 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2293  phosphatidylserine decarboxylase, putative  49 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  25.63 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  27.89 
 
 
286 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.65 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  30.24 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  29.31 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.66 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  29.28 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  26.36 
 
 
325 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  28.5 
 
 
303 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  31.13 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2685  phosphatidylserine decarboxylase-related  27 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  27.48 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
262 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 
292 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 
610 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  26.97 
 
 
284 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 
287 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.58 
 
 
294 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
292 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
292 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
292 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
292 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.27 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
262 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  28.45 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  27.05 
 
 
287 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  28.04 
 
 
264 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.05 
 
 
338 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  28.08 
 
 
254 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
289 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.73 
 
 
613 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  27.83 
 
 
288 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.19 
 
 
288 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 
287 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  28.71 
 
 
289 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  26.51 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 
306 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.23 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  28.27 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  25.6 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  25.6 
 
 
283 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  26.51 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  28.3 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  29.11 
 
 
288 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  27.57 
 
 
286 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 
289 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  26.79 
 
 
287 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>