173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2685 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2685  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 
329 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  68.62 
 
 
329 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1483  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  64.02 
 
 
332 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.307575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.18 
 
 
338 aa  407  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1862  phosphatidylserine decarboxylase-related  59.39 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  56.23 
 
 
336 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  57.27 
 
 
334 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  29.8 
 
 
1264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  30.23 
 
 
1053 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  28.49 
 
 
1064 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  29.15 
 
 
301 aa  101  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  29.67 
 
 
306 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.51 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  25.67 
 
 
300 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  27.64 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  28.29 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  28.75 
 
 
286 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  29.11 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  27.89 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  27.2 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.16 
 
 
613 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.75 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  28.22 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.26 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.76 
 
 
610 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.9 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  27.17 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  27.9 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  28.63 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  28.28 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  28.28 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  28.28 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  27.94 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  27.99 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  28.75 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  28.69 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.42 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  28.05 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  28.93 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  28.09 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  28.95 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  26.85 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  27.55 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  30.25 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  25.56 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  29.83 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  32.02 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  28.27 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  25.97 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  27.11 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  26.55 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  26.61 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  26.42 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  25.54 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  25.54 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  25.54 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  25.54 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  26.18 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  29.87 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  28.46 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  25.54 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  21.89 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  25.77 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  23.61 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  26.05 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  28.09 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  27.73 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  25.22 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  27.94 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  27.8 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  28.96 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  25.85 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  26.59 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>