179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0634 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  98.29 
 
 
293 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  77.04 
 
 
273 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  72.3 
 
 
280 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 
286 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  53.11 
 
 
286 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  51.28 
 
 
286 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  50.54 
 
 
303 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  52.21 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  52.38 
 
 
287 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  52.21 
 
 
287 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  55.24 
 
 
288 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  51.84 
 
 
289 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  52.57 
 
 
613 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  51.1 
 
 
287 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  52.57 
 
 
610 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  51.47 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 
285 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  48.19 
 
 
284 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  48.72 
 
 
286 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  45.42 
 
 
292 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  45.42 
 
 
292 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  46.21 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  46.21 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  46.57 
 
 
287 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  45.11 
 
 
286 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  45.82 
 
 
283 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  50.36 
 
 
289 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  44.53 
 
 
286 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  46.18 
 
 
283 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  47.54 
 
 
304 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  46.89 
 
 
288 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  45.14 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  47.99 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  46.32 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  45.09 
 
 
293 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  44.4 
 
 
289 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  44.04 
 
 
292 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  44.04 
 
 
292 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  44.04 
 
 
292 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  44.57 
 
 
286 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  46.91 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  44.84 
 
 
287 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  46.57 
 
 
286 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
322 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  42.55 
 
 
282 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  43.84 
 
 
287 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  45.49 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  45.49 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  45.49 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  42.55 
 
 
282 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  42.24 
 
 
287 aa  235  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  44.48 
 
 
345 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  44.81 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  46.32 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  42.6 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  44 
 
 
294 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  45.49 
 
 
316 aa  232  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  42.14 
 
 
285 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  43.31 
 
 
289 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  46.69 
 
 
280 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  41.88 
 
 
285 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  42.6 
 
 
287 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  42.6 
 
 
288 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  45.76 
 
 
294 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  43.86 
 
 
306 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  42.76 
 
 
342 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  43.11 
 
 
318 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  44.69 
 
 
289 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
299 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  43.01 
 
 
277 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  42.91 
 
 
286 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  45.04 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  41.01 
 
 
286 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  39.93 
 
 
325 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  42.81 
 
 
277 aa  219  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
302 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  41.4 
 
 
284 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  43.27 
 
 
289 aa  215  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  42.39 
 
 
303 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  42.65 
 
 
283 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  42.28 
 
 
283 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  39.92 
 
 
297 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  40.38 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  43.7 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  34.64 
 
 
282 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  36.07 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>