169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1862 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1862  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 335 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1483  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  65.76 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.307575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  62.28 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  65.24 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2685  phosphatidylserine decarboxylase-related  59.39 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  58.72 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  55.73 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 		 1064 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  28.72 
 
 		 1264 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  29.54 
 
 		 1053 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  30.13 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 306 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.53 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  31.34 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.13 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.94 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  26.32 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  30.48 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  26.77 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  30.43 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  28.09 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  25.32 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.25 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.21 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  26.47 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  29.57 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  26.04 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  26.25 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  25.57 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  25.57 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  25.57 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  26.04 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  25.57 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  25.12 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  25.66 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  25.19 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  26.7 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  25.87 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  26.16 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  24.91 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.11 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  22.94 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  23.53 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  26.2 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  25.38 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  24.15 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 		 610 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  24.52 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  22.67 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  25.38 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  25.74 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  25.46 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  26.58 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  25.85 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  25.74 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  25.46 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  25.29 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  25.46 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  26.53 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  26.24 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  25.83 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  25.46 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  25.83 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  25.83 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  27.91 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  26.14 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  25.62 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>