184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2462 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  76.65 
 
 
264 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  55.47 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  55.86 
 
 
262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  55.47 
 
 
262 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  54.9 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  56.47 
 
 
261 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  56.05 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  35.66 
 
 
260 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  31.43 
 
 
286 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  31.07 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  29.56 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  29.2 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  28.15 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  28.15 
 
 
287 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  29.22 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  32.77 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.99 
 
 
287 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  29.3 
 
 
285 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 
280 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.71 
 
 
613 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  31.39 
 
 
298 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  29.7 
 
 
294 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  30.45 
 
 
285 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 
610 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  32.4 
 
 
287 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 
294 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  27.53 
 
 
288 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  32.66 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  29.22 
 
 
280 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  25.74 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  31.05 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
282 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  29.77 
 
 
282 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
322 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.26 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.26 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  30.25 
 
 
285 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  26.47 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  26.71 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  27.46 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  31.76 
 
 
289 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  28.81 
 
 
300 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  29.89 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  28.05 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  31.08 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  30.18 
 
 
1264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  28.4 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  30.65 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30.83 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  30.36 
 
 
283 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
283 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  29.03 
 
 
304 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.52 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 
293 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 
293 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  31.76 
 
 
289 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  31.15 
 
 
1064 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 
293 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 
277 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
292 aa  112  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  30.47 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  28.06 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  33.18 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  26.71 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  29.23 
 
 
287 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.93 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>