186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1409 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  57.35 
 
 		 289 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  54.96 
 
 		 286 aa  315  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  57.35 
 
 		 289 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  56.03 
 
 		 286 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  55.71 
 
 		 287 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  55.36 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  55.36 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  55.27 
 
 		 287 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  54.35 
 
 		 288 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  51.61 
 
 		 286 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  54.68 
 
 		 610 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  53.57 
 
 		 613 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  49.11 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  53.93 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  47.86 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  49.1 
 
 		 306 aa  278  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  50.36 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  46.48 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  46.48 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  49.82 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  46.48 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  46.48 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  50.78 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  50 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  49.42 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  49.42 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  47.25 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  51.45 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  49.28 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  51.25 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  48.91 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  49.26 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  48.23 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  47.87 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  47.06 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  51.56 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  47.52 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  49.22 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  46.52 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  48.52 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  49.11 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  48.31 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  45.71 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  47.66 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  47.66 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  47.66 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  47.27 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  46.49 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  51.87 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  51.42 
 
 		 284 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  47.46 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  47.78 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  47.12 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  46.13 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  47.04 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  45.59 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  45.65 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  46.91 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  49 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  43.06 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  46.64 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  47.66 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  47.33 
 
 		 342 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  49.42 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  45.59 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  44.68 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  45 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  47.25 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  46.89 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  45.91 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  45.19 
 
 		 299 aa  244  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  44.68 
 
 		 277 aa  245  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  44.77 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  43.53 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  44.77 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  44.36 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  45.25 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  43.73 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  45 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  39.72 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  39.36 
 
 		 282 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>