172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5255 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 416 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  70.69 
 
 		 416 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.33 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.33 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.33 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.07 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.33 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  65.81 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  65.55 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.74 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.49 
 
 		 416 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.49 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.49 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.25 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.25 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  42.19 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  37.58 
 
 		 446 aa  302  7.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  36.38 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  36.53 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.79 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.57 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.74 
 
 		 474 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.18 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  55.08 
 
 		 159 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  33.17 
 
 		 1264 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  31.17 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  27.19 
 
 		 1053 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  25.29 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  31.22 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  30.14 
 
 		 1064 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  34.26 
 
 		 294 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  31.53 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  33.18 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 		 306 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  31.03 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 254 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  31.22 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.94 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.94 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  30.94 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  28.5 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  32.18 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.32 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  29.6 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  31.16 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.16 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  29.9 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  28.87 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  30.56 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  28.25 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  26.7 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  27.95 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  22.45 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  27.8 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  28.7 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  28.97 
 
 		 286 aa  67  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.96 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  27.15 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.29 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  24.38 
 
 		 259 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  28.17 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  30.88 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  29.49 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  28.25 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  28.18 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  27.8 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  26.47 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  25.78 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  24.79 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  26.44 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  28.38 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  27.05 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  28.37 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  28.64 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  27.64 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>