182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4806 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  85.07 
 
 		 292 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0342  phosphatidylserine decarboxylase  66.9 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3604  phosphatidylserine decarboxylase  62.41 
 
 		 290 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  60.92 
 
 		 297 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  58.6 
 
 		 293 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.42 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  31.5 
 
 		 345 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  31.51 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  34.08 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  32.97 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  34.81 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  31.6 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  34.19 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  31.16 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  35.29 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  31.75 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  29.51 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  31.75 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  32.86 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  32.37 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  33.7 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  32.72 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  30.57 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  31.88 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  33.96 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.32 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  32.06 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  33.68 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  31.29 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  29.78 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  30.31 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  29.41 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  31.11 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  32.6 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  28.82 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  29.44 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  33.57 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  31.21 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  35.69 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  30.74 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30.95 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  28.68 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  31.32 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  34.07 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  28.68 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  29.59 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  35.07 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  30.88 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.37 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  29.84 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  30.22 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  30.86 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  31 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  32.92 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  29.58 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  32.85 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  32.48 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  30.83 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  28.87 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  29.34 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  33.22 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>