151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3578 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  100 
 
 
417 aa  865    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  33.06 
 
 
430 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  30.67 
 
 
436 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  31.22 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.18 
 
 
416 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.66 
 
 
436 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  28.61 
 
 
446 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.86 
 
 
416 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
433 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.86 
 
 
437 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  29.73 
 
 
433 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.86 
 
 
437 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.88 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.81 
 
 
456 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.42 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.96 
 
 
415 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.84 
 
 
474 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.69 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  28.68 
 
 
347 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.68 
 
 
368 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.25 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  27.05 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  25.95 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  25.48 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  26.36 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  26.5 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  25.64 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  25.64 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  25.64 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  25.64 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  25.64 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  27.9 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  26.32 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  23.17 
 
 
1053 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  27.54 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  23.24 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  26.32 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  26.18 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  26.94 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  24.91 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  23.96 
 
 
1264 aa  67  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  24.33 
 
 
1064 aa  67  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  24.69 
 
 
287 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  27.54 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  24.05 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  25.22 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  25.22 
 
 
277 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  25.52 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  24.05 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  24.05 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  23.97 
 
 
613 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  25.1 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  25.1 
 
 
283 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  26.05 
 
 
285 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 
286 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  25.31 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  24.15 
 
 
610 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  23.63 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  25.1 
 
 
293 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  23.63 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  24.71 
 
 
285 aa  63.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  25.59 
 
 
287 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  23.6 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  24.8 
 
 
293 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  26.92 
 
 
286 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  25.2 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  22.86 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  24.92 
 
 
288 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  23.77 
 
 
292 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  23.77 
 
 
292 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  24.27 
 
 
286 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  24.62 
 
 
292 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  25.63 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  26.91 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>