166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4860 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  100 
 
 
430 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  38.56 
 
 
413 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  38.65 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  38.65 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.86 
 
 
416 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  38.24 
 
 
416 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.68 
 
 
416 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.68 
 
 
437 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.68 
 
 
437 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
433 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
433 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
433 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
430 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
433 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  37.34 
 
 
433 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  37.08 
 
 
433 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  35.35 
 
 
436 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  32.81 
 
 
436 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  30.73 
 
 
446 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  33.41 
 
 
456 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  33.95 
 
 
417 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.06 
 
 
474 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.7 
 
 
474 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  27.18 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  30.13 
 
 
392 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  28.14 
 
 
1264 aa  97.4  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  28.33 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  26.73 
 
 
1064 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  29.15 
 
 
301 aa  94.4  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  31.07 
 
 
1053 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  30.24 
 
 
306 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  27.76 
 
 
347 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  27.34 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.92 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.84 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.84 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  30.84 
 
 
292 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
289 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 
262 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  28.5 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 
262 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.41 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.81 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.41 
 
 
294 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  28.26 
 
 
261 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  31.17 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  29.06 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  30.91 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.18 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.69 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
288 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  26.9 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.3 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  29.91 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  25.74 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.64 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  30.42 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  29.61 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
613 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  25.38 
 
 
300 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  27.8 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.14 
 
 
287 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  26.26 
 
 
259 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  27.1 
 
 
306 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  26.46 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  29.86 
 
 
282 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  29.86 
 
 
282 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  26.05 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 
303 aa  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  29.95 
 
 
293 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  26.01 
 
 
322 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  28.3 
 
 
286 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  27.6 
 
 
286 aa  63.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 
322 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  26.01 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  26.01 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 
288 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  27.96 
 
 
289 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  26.01 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>