More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0948 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  100 
 
 
370 aa  760    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  29.59 
 
 
397 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  25.8 
 
 
392 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  30.14 
 
 
394 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  31.44 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  27.39 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  26.33 
 
 
393 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  26.72 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  30.52 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  26.65 
 
 
392 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  29.38 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  25.46 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  29.97 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  25.8 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  27.03 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  28.8 
 
 
372 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  26.51 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  26.51 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  26.51 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  24.79 
 
 
432 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  25.2 
 
 
406 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  26.63 
 
 
402 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  26.63 
 
 
402 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  25.27 
 
 
393 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.76 
 
 
357 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  22.76 
 
 
425 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  25.66 
 
 
392 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  31.32 
 
 
383 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  25.54 
 
 
383 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  26.44 
 
 
383 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.1 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  23.04 
 
 
419 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  25.2 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  25.07 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  24.93 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.22 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  22.59 
 
 
434 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.22 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  25.53 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  26.26 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  23.78 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  27.7 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  25.46 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  26.46 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  27.36 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  22.52 
 
 
351 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  25.33 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  22.94 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  28.15 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  25.28 
 
 
353 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.33 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  29.65 
 
 
398 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.07 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  24.86 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  24.04 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.28 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.28 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  21.25 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  21.88 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  24.38 
 
 
418 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  29.49 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  23.17 
 
 
359 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.82 
 
 
354 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  24.92 
 
 
361 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  23.17 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  24.86 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  21.25 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  28.65 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.67 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  25.47 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  20.94 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  23.63 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  21.56 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  30.26 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  24.26 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  21.56 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  23.62 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.65 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  30.95 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.65 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  22.28 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  22.53 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  26.84 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  21.47 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  20.67 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  29.48 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  25.81 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  23.1 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  25.07 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  21 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  26.73 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  27.81 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  26.86 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  28.57 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>