More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1560 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  100 
 
 		 356 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  96.35 
 
 		 356 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  55.77 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  55.77 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  53.8 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  54.93 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  52.82 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  49 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  40.74 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  41.64 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  42.37 
 
 		 353 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  41.13 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  41.13 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  40.68 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  40.68 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  42.86 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  40.11 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  40.4 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  40.4 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  40.11 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  40.06 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  42 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  42.37 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  40.29 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  39.66 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  40 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  39.09 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  38.81 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  39.38 
 
 		 356 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  38.53 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  38.53 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  38.24 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  39.38 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  39.77 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  38.53 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  38.53 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  39.82 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  41.76 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  42.49 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  42.13 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  37.29 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  39.66 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  41.26 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  39.48 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  41.19 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  39.47 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  36.08 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  38.28 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  39.94 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  36.78 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  40.41 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  38.27 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  39.83 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  39.41 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  40.22 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  39.67 
 
 		 381 aa  235  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  40.66 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  40.79 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  36.47 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  41.5 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  37.96 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  37.57 
 
 		 361 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  37.98 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  38.92 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  38.08 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  36.18 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  40.54 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  37.81 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  37.97 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  36.26 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  37.53 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  37.53 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  37.53 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  41.45 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  37.26 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  37.26 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  34.58 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  36.07 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  42.66 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  38.48 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  35.31 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  36.44 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  39.88 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0710  peptidase M24  40.58 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  39.72 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  34.01 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  36.63 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  38.96 
 
 		 354 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  37.15 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  37.54 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1603  aminopeptidase P  38.02 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.791664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  33.81 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  33.98 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  35.29 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  32.69 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>