More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4628 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  100 
 
 
367 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  79.23 
 
 
373 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  51.63 
 
 
371 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  49.73 
 
 
366 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  42.78 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  38.72 
 
 
376 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  33.42 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  33.42 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  33.7 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.42 
 
 
365 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  33.42 
 
 
365 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  33.42 
 
 
365 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  33.42 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  33.15 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.15 
 
 
365 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  37.01 
 
 
366 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  32.88 
 
 
365 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  37.4 
 
 
369 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  39.67 
 
 
384 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  39.4 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  32.88 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  40.33 
 
 
380 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  40.33 
 
 
380 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  40.76 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  40.6 
 
 
376 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  36.78 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  34.89 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  39.73 
 
 
388 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  41.14 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  36.29 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  41.37 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  40.97 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  41.73 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  33.71 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  35.16 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  35.37 
 
 
357 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  33.78 
 
 
356 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  38.19 
 
 
361 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  39.08 
 
 
386 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  34.24 
 
 
356 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  34.24 
 
 
356 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  33.97 
 
 
356 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  36.74 
 
 
367 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  36.91 
 
 
373 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  34.23 
 
 
356 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  33.51 
 
 
356 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  33.43 
 
 
351 aa  205  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  33.24 
 
 
356 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  38.9 
 
 
376 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  33.7 
 
 
356 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  36.74 
 
 
371 aa  203  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  41.13 
 
 
376 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  33.42 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  33.43 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  42.3 
 
 
371 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  38.62 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  36.46 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  33.52 
 
 
351 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  36.36 
 
 
358 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  35.54 
 
 
353 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  32.43 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  37.09 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  36.15 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  37.98 
 
 
374 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  40.71 
 
 
373 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  35.14 
 
 
364 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  35.97 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  32.51 
 
 
357 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  32.13 
 
 
355 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  32.35 
 
 
353 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  32.35 
 
 
353 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  38.04 
 
 
359 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  38.8 
 
 
374 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  30.05 
 
 
359 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  34.94 
 
 
361 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  39.31 
 
 
355 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  32.97 
 
 
362 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  31.77 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  32.23 
 
 
351 aa  189  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  32.42 
 
 
359 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  32.13 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  32.13 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  37.43 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  33.24 
 
 
361 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.49 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  42.69 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  39.91 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.22 
 
 
353 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.22 
 
 
353 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  31.59 
 
 
369 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  32.51 
 
 
369 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  37.57 
 
 
347 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  35.23 
 
 
361 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  31.89 
 
 
362 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>