More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3444 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 		 394 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  88.69 
 
 		 394 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  98.98 
 
 		 394 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  76.88 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  71.67 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  36.27 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  38.18 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  39.06 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  36.75 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  38.66 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  38.15 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  39.74 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  33.67 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  32.9 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  31.46 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  31.54 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  30.43 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  32.39 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  37.53 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  34.6 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  30.77 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  32.81 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  29.05 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  29.49 
 
 		 392 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  27.96 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  33.77 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  28.43 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  28.53 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  29.74 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  30 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  30 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  28.53 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  29.23 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  29.23 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  27.65 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  27.95 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  27.95 
 
 		 399 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  27.69 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  32.08 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  30 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  28.06 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  31.76 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  28.21 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  32.54 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  28.13 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  32.25 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  26.72 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  29.85 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  31.87 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  26.98 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.83 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  28.95 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  32.1 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.32 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.05 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  29.97 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.92 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  30.93 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.81 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.11 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.11 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.66 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  24.39 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  31.03 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.25 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.39 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.12 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.98 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.28 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.25 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.25 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.25 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  30.95 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.25 
 
 		 365 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.25 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.98 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.25 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.25 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.08 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.98 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.35 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.98 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  28.87 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.38 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  34.6 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.13 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.16 
 
 		 353 aa  111  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  25.99 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  28.53 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.41 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  26.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  29.54 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.53 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  30.71 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  30.35 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  29.65 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  28.57 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  23.43 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  28.98 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>