More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000632 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
395 aa  826    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  62.31 
 
 
419 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  62.15 
 
 
396 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  61.22 
 
 
403 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  61.7 
 
 
402 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  61.44 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  61.44 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  61.44 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  61.18 
 
 
402 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  62.72 
 
 
393 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  59.95 
 
 
399 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  61.18 
 
 
402 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  61.68 
 
 
393 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  59.9 
 
 
406 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  61.46 
 
 
371 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  61.42 
 
 
393 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  62.21 
 
 
393 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  61.18 
 
 
393 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  59.69 
 
 
392 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  59.02 
 
 
392 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  49.35 
 
 
389 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  47.4 
 
 
392 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  46.13 
 
 
393 aa  363  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  45.31 
 
 
392 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  44.13 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  40.82 
 
 
397 aa  319  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  41.33 
 
 
393 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  31.83 
 
 
425 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  33.83 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  32.07 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  31.62 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  30.81 
 
 
418 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  28.07 
 
 
394 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  29.55 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  29.35 
 
 
388 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  28.83 
 
 
397 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  28.21 
 
 
394 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.96 
 
 
394 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  28.57 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  28.72 
 
 
403 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  26.53 
 
 
437 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  30.18 
 
 
383 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  30.03 
 
 
383 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  30.18 
 
 
383 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  31.36 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  28.99 
 
 
383 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  30.77 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  26.87 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  27.66 
 
 
384 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  29.88 
 
 
383 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  25.82 
 
 
384 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  27.25 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  25.32 
 
 
369 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  25.13 
 
 
390 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
461 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  21.52 
 
 
356 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  21.47 
 
 
357 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  24.81 
 
 
373 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.97 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  21.52 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  24.87 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.65 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  20.57 
 
 
356 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  21 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.46 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  20.57 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  26.18 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  20.31 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  20.57 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  20.31 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  25.13 
 
 
448 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.98 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  25.06 
 
 
410 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.71 
 
 
365 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  20.52 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.45 
 
 
365 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.19 
 
 
381 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  28.02 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  26.09 
 
 
365 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  20.47 
 
 
356 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.14 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  20.26 
 
 
358 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.32 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  39.17 
 
 
171 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.05 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  24.81 
 
 
366 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.51 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  24.94 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  22.8 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  24.26 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  23.62 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  23.55 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  20.21 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  24.48 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  21.32 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>