More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6020 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  84.95 
 
 		 403 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  100 
 
 		 402 aa  831    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  83.96 
 
 		 406 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  94.53 
 
 		 402 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  95.52 
 
 		 402 aa  774    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  76.65 
 
 		 396 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  100 
 
 		 402 aa  831    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  94.53 
 
 		 402 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  95.27 
 
 		 402 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  83.12 
 
 		 399 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  79.25 
 
 		 371 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  72.38 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  72.75 
 
 		 393 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  71.87 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  71.36 
 
 		 393 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  70.95 
 
 		 393 aa  584  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  68.97 
 
 		 392 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  65.9 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  61.18 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  60.88 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  49.1 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  47.69 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  47.09 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  47.03 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  47.04 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  43.59 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  44.05 
 
 		 393 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  31.99 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  31.41 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  29.85 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  31.12 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  29.49 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  29.87 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  28.54 
 
 		 414 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  30.54 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  30.17 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  29.74 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  29.74 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  30.96 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  29.04 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  30.16 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  28.33 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  28.61 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  28.61 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  24.83 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  27.74 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  27.55 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  28.02 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  28.61 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  28.05 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  25.89 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 461 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  26.11 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  26.51 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.51 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  25.87 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  26.76 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.85 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.21 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.13 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  24.94 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.04 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.39 
 
 		 356 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  23.58 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.32 
 
 		 356 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.32 
 
 		 356 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  23.12 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  23.02 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  23.45 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  22.37 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  22.48 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  26.45 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.67 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.1 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  26.98 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  27.02 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  27.02 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  24.81 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  23.18 
 
 		 353 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.86 
 
 		 448 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  24.49 
 
 		 379 aa  89.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  22.62 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.13 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  41.67 
 
 		 171 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.83 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.49 
 
 		 356 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  26.98 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.64 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  24.87 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.35 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  24.87 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  23.08 
 
 		 362 aa  86.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  23.9 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.1 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  22.14 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  25.13 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  22.54 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  22.31 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  23.1 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  25.06 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>