More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4409 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  100 
 
 		 419 aa  838    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  62.47 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  52.41 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  51.07 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  45.29 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  45.62 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  44.07 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  44.87 
 
 		 404 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  45.01 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  43.08 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  44.59 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  45.43 
 
 		 409 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  43.3 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  42.49 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  41.58 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  42.6 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  42.31 
 
 		 405 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  42.31 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  42.31 
 
 		 400 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  41.79 
 
 		 399 aa  279  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  38.83 
 
 		 405 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  37.99 
 
 		 381 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  38.04 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  35.84 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  36.87 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  35.13 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  34.31 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  41.56 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  34.79 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  33.9 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.14 
 
 		 365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  35.41 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.04 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.04 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.59 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.04 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.32 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.04 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.04 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.04 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.04 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  28.77 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  33.62 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  32.04 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  33.9 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  36.44 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  30.49 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  31.58 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  35.85 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.32 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.27 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  29.82 
 
 		 373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  29.4 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  28.86 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  31.96 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  34.68 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  34.83 
 
 		 361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  30.77 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  33.81 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  29.29 
 
 		 361 aa  143  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  30.71 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.88 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  34.92 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.11 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.52 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  32.8 
 
 		 374 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  33.63 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  33.33 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  30.8 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  28.86 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  32.69 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  32.53 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  32.19 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  31.98 
 
 		 380 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  32.45 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  31.98 
 
 		 380 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  27.42 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0732  peptidase M24  30.96 
 
 		 351 aa  136  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000296906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  28.18 
 
 		 356 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  27.42 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  27.42 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.55 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.55 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  32.58 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  32.99 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  29.28 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00940  hypothetical protein  30.91 
 
 		 513 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  27.07 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  34.19 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  34.83 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  27.22 
 
 		 356 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  28.29 
 
 		 358 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  32.36 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  33.11 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  27.5 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  30.63 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  34.15 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  34.14 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  29.24 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.91 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>