More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1459 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  100 
 
 
409 aa  857    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  65.28 
 
 
405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  63.33 
 
 
405 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  63.81 
 
 
405 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  62.32 
 
 
412 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  63.46 
 
 
404 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  63.05 
 
 
403 aa  534  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  60.86 
 
 
419 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  56.33 
 
 
401 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  59.05 
 
 
420 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  55.66 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  54.19 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  54.05 
 
 
405 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  53.55 
 
 
405 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  52.22 
 
 
405 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  47.41 
 
 
399 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  46.17 
 
 
400 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  46.17 
 
 
400 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  43.96 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 
453 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  40.86 
 
 
435 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  43.15 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  42.45 
 
 
377 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  43.54 
 
 
381 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  41.75 
 
 
380 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  42.23 
 
 
380 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  42.4 
 
 
380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  39.53 
 
 
448 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  33.98 
 
 
359 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  32.08 
 
 
372 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  32.13 
 
 
376 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.76 
 
 
380 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.76 
 
 
380 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.76 
 
 
373 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  31.37 
 
 
376 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  30 
 
 
364 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  27.37 
 
 
365 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  27.37 
 
 
365 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  30.56 
 
 
386 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.37 
 
 
365 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  31.88 
 
 
371 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.37 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.1 
 
 
365 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  27.37 
 
 
365 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  27.1 
 
 
365 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  27.47 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.12 
 
 
369 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
365 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  26.83 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  29.22 
 
 
380 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  30.3 
 
 
378 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.57 
 
 
367 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  30.55 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  31.48 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.86 
 
 
357 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  31.22 
 
 
374 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.11 
 
 
376 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  29.38 
 
 
397 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  30.14 
 
 
382 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.75 
 
 
373 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  31.56 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.49 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  30.46 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  29.97 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  28.3 
 
 
369 aa  139  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  32.07 
 
 
375 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  29.5 
 
 
366 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  28.41 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  30.52 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  28.41 
 
 
358 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  27.69 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  26.79 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  30.03 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  27.7 
 
 
354 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  26.89 
 
 
351 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  30.03 
 
 
383 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  26.89 
 
 
351 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  27.22 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  28.29 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  27.78 
 
 
365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  31.3 
 
 
361 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  27.75 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  30.12 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  30.12 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  28.14 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  30.17 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.42 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.58 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.17 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.18 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.28 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  31.44 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>