More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3031 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  100 
 
 
405 aa  843    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  57.04 
 
 
404 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  54.81 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  55.89 
 
 
412 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  54.48 
 
 
405 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  55.8 
 
 
405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  55.69 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  53.73 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  52.74 
 
 
405 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  52.22 
 
 
409 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  54.31 
 
 
420 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  52.87 
 
 
419 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  52.58 
 
 
409 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  50 
 
 
401 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  48.26 
 
 
399 aa  364  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  46.27 
 
 
402 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  48.26 
 
 
400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  47.76 
 
 
400 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  43.92 
 
 
381 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  42.34 
 
 
453 aa  316  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  42.89 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  42.33 
 
 
380 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  41.34 
 
 
414 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  41.05 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  37.14 
 
 
435 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  41.78 
 
 
377 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  38.86 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  39.47 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  34.83 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  33.61 
 
 
372 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  31.75 
 
 
380 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  31.75 
 
 
380 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  31.75 
 
 
373 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.97 
 
 
376 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  32.41 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  33.14 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  31.75 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  30.88 
 
 
353 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.44 
 
 
362 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  32.39 
 
 
384 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  30.14 
 
 
364 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.37 
 
 
351 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.37 
 
 
351 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  30.3 
 
 
367 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  31.78 
 
 
386 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  33.53 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  28.37 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.95 
 
 
365 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  27.95 
 
 
365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  27.67 
 
 
365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  33.7 
 
 
366 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  29.86 
 
 
361 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  27.4 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  31.22 
 
 
371 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  29.61 
 
 
367 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  33.89 
 
 
374 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  31.59 
 
 
371 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.61 
 
 
357 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  28.3 
 
 
358 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  27.67 
 
 
365 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.22 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  28.3 
 
 
358 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  29.41 
 
 
358 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.01 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  32.59 
 
 
376 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  33.14 
 
 
375 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  29.52 
 
 
353 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  29.52 
 
 
353 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  33.52 
 
 
366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  27.67 
 
 
369 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  31.2 
 
 
383 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  32.77 
 
 
371 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.3 
 
 
357 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  29.41 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  31.52 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  30.81 
 
 
384 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.22 
 
 
364 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  33.33 
 
 
374 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.53 
 
 
354 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  29.27 
 
 
356 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  28.46 
 
 
352 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  29 
 
 
356 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  31.33 
 
 
369 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  28.73 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.87 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  29.27 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  36.55 
 
 
348 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  34.26 
 
 
353 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  34.69 
 
 
353 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  29.3 
 
 
357 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  34.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  34.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  32.45 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  34.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>