More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3488 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 453 aa  946    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  61.92 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  51.67 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  53.02 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  41.85 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  40.76 
 
 		 405 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  43.38 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  41.27 
 
 		 405 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  40.25 
 
 		 405 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  41.33 
 
 		 412 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  43.26 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  43.69 
 
 		 409 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  40.36 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  40.21 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  42.35 
 
 		 420 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  42.09 
 
 		 405 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  37.81 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  42.34 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  39.54 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  38.58 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  38.52 
 
 		 381 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  38.58 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  38.32 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  36.68 
 
 		 380 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  39.3 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  36.7 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  35.2 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  34.81 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  31.28 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  30.58 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.4 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.4 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  28.81 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.49 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.49 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  30.25 
 
 		 373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.49 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.49 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.22 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.67 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.22 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.22 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.38 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  29.41 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.38 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.84 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  30.11 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  30.68 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.46 
 
 		 364 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  30.56 
 
 		 369 aa  160  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.11 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  31.75 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  33.22 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  29.02 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.85 
 
 		 378 aa  156  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  28.72 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  27.42 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  29.54 
 
 		 366 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  30.33 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  27.35 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  30.92 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.21 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  31.02 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.21 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  28.22 
 
 		 358 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  29.43 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  30.14 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  27.95 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.95 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  27.05 
 
 		 354 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  29.87 
 
 		 386 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.67 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  26.11 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  31.02 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  33.33 
 
 		 353 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  33.33 
 
 		 353 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.7 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  26.43 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  28.65 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  31.73 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  29.73 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00940  hypothetical protein  30.15 
 
 		 513 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  33.47 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  26.67 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  33.47 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0732  peptidase M24  27.17 
 
 		 351 aa  138  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000296906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  33.47 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  26.43 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  30.28 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.74 
 
 		 351 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  30.11 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  30.25 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  33.47 
 
 		 356 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  28.69 
 
 		 359 aa  136  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.69 
 
 		 359 aa  136  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  29.38 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  33.05 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  36.32 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  29.49 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  29.13 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>