More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1028 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  83.21 
 
 		 405 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  85.43 
 
 		 405 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  100 
 
 		 405 aa  842    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  80.1 
 
 		 412 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  74.63 
 
 		 403 aa  627  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  73.07 
 
 		 404 aa  626  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  67.79 
 
 		 419 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  63.33 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  63.33 
 
 		 409 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  60.5 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  60.81 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  58.81 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  59.01 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  54.48 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  54.48 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  48.38 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  47.38 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  47.38 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  44.3 
 
 		 435 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  44.22 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  45.69 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  40.25 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  42.67 
 
 		 377 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  42.4 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  41.41 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  42.93 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  42.4 
 
 		 380 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  42.01 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  31.52 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.98 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.71 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  30.98 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  30.71 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  32.5 
 
 		 376 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.84 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.06 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.06 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.78 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.04 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  31.55 
 
 		 359 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.88 
 
 		 353 aa  170  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  31.65 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  28.61 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  31.44 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.69 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.69 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  33.07 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  36.57 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  30.81 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  33.96 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  31.12 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  32.62 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  31.46 
 
 		 367 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  31.02 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  31.08 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  29.97 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  35.1 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  34.19 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  28.37 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  35.33 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  28.37 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  33.85 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  34.44 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  32.29 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  31.58 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  32.46 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  28.1 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  32.96 
 
 		 386 aa  150  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  33.15 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  30.53 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.03 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.04 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  32.35 
 
 		 348 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  34.26 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  27.72 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.83 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  34.03 
 
 		 353 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  35.24 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  32.58 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  31.03 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.65 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  29.97 
 
 		 368 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  29.88 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  34.45 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  34.03 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.67 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  34.03 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.27 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>