More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1893 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  100 
 
 
372 aa  739    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  42.78 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  42.62 
 
 
373 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  43.48 
 
 
366 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  41.64 
 
 
371 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  37.57 
 
 
364 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  37.67 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  35.36 
 
 
365 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  35.08 
 
 
365 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  35.36 
 
 
365 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  35.08 
 
 
365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  35.08 
 
 
365 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  35.08 
 
 
365 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  35.08 
 
 
365 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  35.08 
 
 
365 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  34.81 
 
 
365 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  34.81 
 
 
365 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  38.62 
 
 
367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  33.24 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  34.79 
 
 
357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  33.7 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  38.38 
 
 
371 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  39.14 
 
 
397 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.37 
 
 
353 aa  204  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  32.41 
 
 
351 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  32.41 
 
 
351 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  37.47 
 
 
376 aa  203  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  31.69 
 
 
358 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  34.35 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  37.26 
 
 
366 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  41.22 
 
 
357 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  37.19 
 
 
359 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  38.21 
 
 
384 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  31.42 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  32.3 
 
 
351 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  29.73 
 
 
359 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  37.73 
 
 
359 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.49 
 
 
356 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  30.54 
 
 
354 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  33.24 
 
 
361 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  34.63 
 
 
347 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  33.52 
 
 
369 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  35.71 
 
 
358 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  34.93 
 
 
403 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  44.18 
 
 
381 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  32.33 
 
 
362 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  33.15 
 
 
357 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  34.97 
 
 
347 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  36.74 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  41.7 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  34.88 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  35.41 
 
 
378 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  32.96 
 
 
353 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  33.06 
 
 
369 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  40.09 
 
 
358 aa  188  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  39.39 
 
 
355 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  38.08 
 
 
369 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  37.26 
 
 
361 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.86 
 
 
353 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  34.71 
 
 
353 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  38.82 
 
 
336 aa  185  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  36.7 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  34.6 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  36.26 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  31.28 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  31.56 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  34.69 
 
 
373 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 
414 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  29.36 
 
 
356 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.58 
 
 
353 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.58 
 
 
353 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.58 
 
 
353 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  32.2 
 
 
352 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  31.39 
 
 
361 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  30.19 
 
 
356 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  32.69 
 
 
353 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.3 
 
 
353 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  32.87 
 
 
369 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.3 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  29.76 
 
 
356 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.3 
 
 
353 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  37.2 
 
 
359 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  29.36 
 
 
356 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  31.96 
 
 
366 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  38.25 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  36.8 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  33.61 
 
 
405 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  35.41 
 
 
361 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.02 
 
 
353 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  29.36 
 
 
356 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  29.36 
 
 
356 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  49.27 
 
 
348 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  37.14 
 
 
354 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.02 
 
 
353 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  31.38 
 
 
366 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  33.42 
 
 
412 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  36.44 
 
 
353 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  36.44 
 
 
353 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  37.47 
 
 
388 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  29.92 
 
 
356 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>