More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1358 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  100 
 
 
347 aa  702    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  61.49 
 
 
347 aa  421  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  55.26 
 
 
348 aa  346  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  48.41 
 
 
353 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  48.27 
 
 
353 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  46.18 
 
 
353 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  45.48 
 
 
353 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  45.88 
 
 
353 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  45.29 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  42 
 
 
354 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  45.29 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  45.88 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  44.22 
 
 
356 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  42.17 
 
 
357 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  41.21 
 
 
356 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  41.21 
 
 
356 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  41.21 
 
 
356 aa  288  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  40.92 
 
 
356 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  44.93 
 
 
359 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  40.92 
 
 
356 aa  285  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  43.27 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  40.35 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  46.11 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  40.35 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  40.52 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  40.63 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  40.35 
 
 
356 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  40.35 
 
 
356 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  42 
 
 
359 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  42.4 
 
 
354 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  41.04 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  41.04 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  42.77 
 
 
367 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  43.86 
 
 
348 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  46.78 
 
 
355 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  41.57 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  40.63 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  41.3 
 
 
357 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  41.78 
 
 
364 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  40.58 
 
 
353 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  39.48 
 
 
356 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  42.69 
 
 
357 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  37.75 
 
 
353 aa  249  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  44.25 
 
 
355 aa  248  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  42.15 
 
 
356 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  41.31 
 
 
356 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  41.55 
 
 
364 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  40.46 
 
 
369 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  43.03 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  40.9 
 
 
362 aa  243  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  37.64 
 
 
355 aa  242  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  44.57 
 
 
357 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  37.11 
 
 
359 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  37.11 
 
 
359 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  39.31 
 
 
361 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  39.31 
 
 
361 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  40.11 
 
 
361 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  39.31 
 
 
361 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  39.02 
 
 
361 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  37.57 
 
 
362 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  39.02 
 
 
361 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  38.73 
 
 
361 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  39.02 
 
 
361 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  41.89 
 
 
359 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  39.61 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  37.46 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  38.44 
 
 
361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  39.29 
 
 
361 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  41.45 
 
 
363 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  39.02 
 
 
360 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  35.9 
 
 
357 aa  229  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  38.75 
 
 
354 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  36.02 
 
 
355 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  37.86 
 
 
361 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  38.9 
 
 
352 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  36.41 
 
 
358 aa  226  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  37.08 
 
 
369 aa  225  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  39.69 
 
 
354 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  38 
 
 
366 aa  225  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  36.42 
 
 
362 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  38.97 
 
 
396 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  39.04 
 
 
364 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  36.89 
 
 
360 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  40.23 
 
 
362 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0747  aminopeptidase P  37.97 
 
 
365 aa  222  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00500087  hitchhiker  0.000760117 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  36.42 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  37.21 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0604  peptidase M24  37.46 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.10841  decreased coverage  0.00345461 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  34.57 
 
 
358 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  37.54 
 
 
376 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  38.04 
 
 
364 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  37.57 
 
 
374 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  37.4 
 
 
388 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  36.86 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  36.86 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>