More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1271 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  100 
 
 
351 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  76.07 
 
 
351 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  76.07 
 
 
351 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  52.07 
 
 
353 aa  349  4e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  46.78 
 
 
365 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  45.66 
 
 
365 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  45.66 
 
 
365 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  45.66 
 
 
365 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  45.66 
 
 
365 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  45.66 
 
 
365 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  45.66 
 
 
365 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  45.66 
 
 
365 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  46.91 
 
 
364 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  44.82 
 
 
365 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  45.38 
 
 
365 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  45.38 
 
 
365 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  44.94 
 
 
364 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  43.18 
 
 
369 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  42.02 
 
 
361 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  42.37 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  43.68 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  40.73 
 
 
361 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  41.18 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  41.06 
 
 
369 aa  260  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  37.01 
 
 
371 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  38.78 
 
 
356 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  35.39 
 
 
357 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  36.26 
 
 
358 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  35.85 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  36.71 
 
 
347 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  34.55 
 
 
357 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  36.65 
 
 
356 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  36.16 
 
 
353 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  35.33 
 
 
354 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  33.24 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  37.5 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  36.52 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  36.08 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  35.33 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  35.8 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  35.51 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  34.17 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  35.23 
 
 
356 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  35.23 
 
 
356 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  35.23 
 
 
356 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  35.23 
 
 
356 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  34.07 
 
 
353 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  36.36 
 
 
356 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  35.06 
 
 
347 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  34.75 
 
 
353 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  44.3 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  44.74 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  33.43 
 
 
367 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  44.44 
 
 
353 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  32.69 
 
 
353 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  32.69 
 
 
353 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  35.1 
 
 
359 aa  202  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  31.94 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  35.77 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  31.65 
 
 
359 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  33.52 
 
 
367 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  32.31 
 
 
366 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  43.11 
 
 
361 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  43.11 
 
 
361 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  43.11 
 
 
361 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  31.09 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  32.96 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  38.24 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  31.64 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  42.22 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  42.67 
 
 
361 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  42.67 
 
 
361 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  42.67 
 
 
361 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  31.4 
 
 
359 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  37.08 
 
 
361 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.91 
 
 
366 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  34.85 
 
 
323 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  37.76 
 
 
366 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  42.22 
 
 
361 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  30.62 
 
 
356 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  32.31 
 
 
353 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  33.71 
 
 
352 aa  192  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  38.98 
 
 
355 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  31.86 
 
 
373 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  41.33 
 
 
361 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  33.14 
 
 
352 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.84 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  33.53 
 
 
383 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  36.78 
 
 
348 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  34.04 
 
 
375 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  33.8 
 
 
363 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  40.52 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  36.62 
 
 
323 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>