More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0688 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  73.88 
 
 		 405 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  74.63 
 
 		 405 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  75.12 
 
 		 405 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  77.06 
 
 		 412 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  100 
 
 		 403 aa  831    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  73.7 
 
 		 404 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  69.78 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  63.05 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  64.71 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  63.04 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  61.14 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  59.85 
 
 		 401 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  60.4 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  56.47 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  55.69 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  48.88 
 
 		 400 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  49.63 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  46.19 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  48.88 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  45.43 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  41.71 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  40.36 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  44.5 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  45.48 
 
 		 380 aa  338  8e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  42.86 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  45.74 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  44.27 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  43.41 
 
 		 448 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  34.93 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  39.17 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  33.62 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  36.11 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  33.33 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  30.93 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.27 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  31.42 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  30.45 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  36.22 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  31.3 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.33 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.46 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.33 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  37.54 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  34.77 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  32.13 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  34.82 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  29.89 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  33.43 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  32.22 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  34.08 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  31.93 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  32.98 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  36.1 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.4 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.09 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.09 
 
 		 365 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.09 
 
 		 365 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.4 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.09 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.4 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.09 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  37.18 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.09 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  35.96 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  30.36 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.94 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.03 
 
 		 351 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.03 
 
 		 351 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  32.42 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  31.62 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  30.08 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  34.03 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  34.01 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  28.85 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  34.24 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.53 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  30.18 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  35.25 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  35.42 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  37.14 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.34 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.39 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  35.28 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  29.97 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  31.83 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.81 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  35.85 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  31.3 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  31.01 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.82 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.69 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.44 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.69 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  28.07 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  31.06 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  34.67 
 
 		 361 aa  143  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.44 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  27.67 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.44 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.44 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>