More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1673 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  100 
 
 
381 aa  774    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  42.9 
 
 
362 aa  296  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  41.18 
 
 
363 aa  282  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  41.85 
 
 
362 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  40.97 
 
 
369 aa  265  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  35.96 
 
 
356 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  35.31 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  36.24 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  36.24 
 
 
356 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  36.24 
 
 
356 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  35.67 
 
 
353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  35.67 
 
 
353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  36.24 
 
 
356 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  36.52 
 
 
356 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  35.67 
 
 
356 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  35.67 
 
 
356 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  38.89 
 
 
357 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  37.12 
 
 
357 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  35.67 
 
 
356 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  42.7 
 
 
372 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  35.96 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  41.34 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  41.24 
 
 
348 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  40.6 
 
 
359 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  36.03 
 
 
357 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  39.24 
 
 
361 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  35.93 
 
 
353 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  37.85 
 
 
359 aa  239  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  34.35 
 
 
356 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  39.94 
 
 
356 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  35.93 
 
 
353 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  37.6 
 
 
353 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  35.38 
 
 
353 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  39.67 
 
 
356 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  39.61 
 
 
347 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.38 
 
 
353 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  37.05 
 
 
353 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  38.23 
 
 
354 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  34.92 
 
 
353 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  36.75 
 
 
353 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  40.5 
 
 
357 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  35.34 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  36.16 
 
 
355 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  37.64 
 
 
353 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  35.34 
 
 
359 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  36.59 
 
 
371 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  38.9 
 
 
360 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  36.87 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  37.57 
 
 
347 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  37.46 
 
 
367 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  34.26 
 
 
352 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  35.16 
 
 
361 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  37.29 
 
 
356 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  38.46 
 
 
357 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  40.22 
 
 
348 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  39.12 
 
 
356 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  32.49 
 
 
357 aa  207  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  39.67 
 
 
369 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  39.73 
 
 
364 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  36.15 
 
 
393 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  38.94 
 
 
359 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  38.82 
 
 
356 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  31.58 
 
 
360 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  37.95 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  38.03 
 
 
376 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  39.94 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  37.43 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  32.48 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  33.91 
 
 
357 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  38.9 
 
 
363 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  34.15 
 
 
378 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  35.54 
 
 
361 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  35.54 
 
 
361 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  35.54 
 
 
361 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  31.32 
 
 
358 aa  193  3e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  35.54 
 
 
361 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  35.81 
 
 
361 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  35.26 
 
 
361 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  34.94 
 
 
352 aa  192  8e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  44.18 
 
 
372 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  32.68 
 
 
364 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  35.26 
 
 
361 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  35.26 
 
 
361 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  35.25 
 
 
355 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  35.2 
 
 
354 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  34.99 
 
 
361 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  34.32 
 
 
374 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  33.79 
 
 
358 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.09 
 
 
356 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  39.12 
 
 
379 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  38.24 
 
 
357 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  34.83 
 
 
364 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  37.6 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>