More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1929 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  100 
 
 
356 aa  731    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  76.12 
 
 
356 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  62.08 
 
 
356 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  63.2 
 
 
357 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  55.17 
 
 
353 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  47.7 
 
 
353 aa  343  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  37.36 
 
 
357 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  38.29 
 
 
372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  34.53 
 
 
363 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  39.12 
 
 
381 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  33.9 
 
 
356 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  36.89 
 
 
369 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  34.44 
 
 
362 aa  206  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  34.55 
 
 
362 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  34.19 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  38.46 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  37.5 
 
 
365 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  37.78 
 
 
359 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  32.68 
 
 
354 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  29.86 
 
 
356 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  31.62 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  33.8 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  31.58 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  34 
 
 
353 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  35.99 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  31.71 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  29.43 
 
 
356 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  31.43 
 
 
353 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  31.43 
 
 
353 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  36.31 
 
 
364 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.32 
 
 
353 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  35.55 
 
 
347 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  31.14 
 
 
353 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  29.67 
 
 
356 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  30.27 
 
 
356 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  28.57 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  29.19 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  33.99 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  36.3 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.75 
 
 
353 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  35.8 
 
 
360 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  30.46 
 
 
353 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  28.57 
 
 
356 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  37.04 
 
 
363 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  38.03 
 
 
396 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  30.64 
 
 
353 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  29.97 
 
 
364 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  32.1 
 
 
352 aa  169  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  37.61 
 
 
379 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  30.2 
 
 
357 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  30.79 
 
 
353 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  33.99 
 
 
362 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  32.8 
 
 
393 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  36.02 
 
 
348 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  30.41 
 
 
351 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  32.35 
 
 
379 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  34.28 
 
 
358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  34.43 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  31.05 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  33.05 
 
 
397 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  29.3 
 
 
357 aa  165  9e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  31.38 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  31.22 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  30 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  31.53 
 
 
356 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  35.04 
 
 
357 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  31.71 
 
 
388 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  30.66 
 
 
365 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  35.33 
 
 
359 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  32.68 
 
 
358 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  29.97 
 
 
371 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  31.14 
 
 
361 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  31.75 
 
 
374 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  31.23 
 
 
364 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.39 
 
 
365 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  30.17 
 
 
367 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  30.57 
 
 
361 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  30.66 
 
 
365 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.66 
 
 
365 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.66 
 
 
365 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  30.57 
 
 
361 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  36.16 
 
 
372 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  30.57 
 
 
361 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  30.66 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  30.66 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.25 
 
 
365 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  30.66 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  30.39 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  34.58 
 
 
370 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  41.41 
 
 
376 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>