More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5250 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  100 
 
 		 365 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  66.49 
 
 		 364 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3753  peptidase M24  65.52 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  61.97 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  58.79 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  59.08 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2404  peptidase M24  60.85 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2398  peptidase M24  60.85 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.701554  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2650  peptidase M24  64.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  62.1 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2357  peptidase M24  61.9 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  57.77 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  55.65 
 
 		 362 aa  351  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  53.99 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  50 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  50.95 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  41.99 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  41.27 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  48.03 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  38.5 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  43.09 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  39.06 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  45.4 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  36.99 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  36.99 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  40.78 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  35.26 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  37.33 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  40.06 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  39.22 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  38.55 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  38.94 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  38.94 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  38.94 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  38.94 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  39.5 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  38.94 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  37.29 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  38.89 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  42.47 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  35.26 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  39.22 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  38.4 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  37.95 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  35.18 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  34.71 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  35.26 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  41.83 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  40.33 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  37.33 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  38.66 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  37.19 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  34.27 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  39.72 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  41.83 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  38.02 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  39.72 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  37.46 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  40 
 
 		 348 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  35.39 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  35.56 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  44.17 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  34.66 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  36.64 
 
 		 363 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  42.49 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  39.06 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  41.55 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  36.91 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  37.36 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  34.06 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  34.06 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  36.46 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  38.06 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  35.34 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  38.08 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  39.89 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  34.25 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  38.63 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  34.78 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  38.33 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  37.13 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  37.81 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  37.81 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  36.81 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  37.81 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  32.96 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  37.13 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  37.53 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  37.53 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  38.23 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  37.26 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  30.62 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  31.68 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  36.1 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  35.26 
 
 		 353 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>