More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1824 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  100 
 
 
356 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  64.33 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  60.56 
 
 
355 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  56.62 
 
 
356 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  55.77 
 
 
356 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  57.18 
 
 
355 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  52.96 
 
 
359 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  46.46 
 
 
356 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  49.72 
 
 
363 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  47.54 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  47.79 
 
 
353 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  42.61 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  44.84 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  44.25 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  43.71 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  43.95 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  42.9 
 
 
354 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  44.54 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  44.25 
 
 
353 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  44.25 
 
 
353 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  44.25 
 
 
353 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  44.25 
 
 
353 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  43.95 
 
 
353 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  43.95 
 
 
353 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  42.05 
 
 
356 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  41.76 
 
 
356 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  45.87 
 
 
357 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  41.19 
 
 
356 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  41.19 
 
 
356 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  41.19 
 
 
356 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  41.48 
 
 
356 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  42.36 
 
 
356 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  41.19 
 
 
356 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  40.91 
 
 
356 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  44.25 
 
 
357 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  43.02 
 
 
357 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  39.94 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  39.94 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  40.71 
 
 
353 aa  272  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  42.98 
 
 
359 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  40.98 
 
 
359 aa  268  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  42.15 
 
 
347 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  40.37 
 
 
359 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  42.73 
 
 
354 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  45.82 
 
 
348 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  40.34 
 
 
359 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  43.23 
 
 
352 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  39.65 
 
 
353 aa  258  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  41.01 
 
 
364 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  41.59 
 
 
367 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  42.82 
 
 
354 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  42.07 
 
 
360 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  38.98 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  43.06 
 
 
357 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  44.41 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  39.12 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  39.22 
 
 
361 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  38.02 
 
 
355 aa  249  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  43.42 
 
 
363 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  42.22 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  38.7 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  40.41 
 
 
364 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  38.42 
 
 
360 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  42.34 
 
 
364 aa  242  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  40.5 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  41.23 
 
 
354 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  40.71 
 
 
360 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  39.77 
 
 
366 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  38.18 
 
 
357 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  38.51 
 
 
362 aa  238  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  40.29 
 
 
376 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  40.59 
 
 
356 aa  235  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  40 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  37.29 
 
 
381 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  35.77 
 
 
362 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  36.02 
 
 
355 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  38.44 
 
 
361 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  37.43 
 
 
363 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  38.31 
 
 
361 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  34.27 
 
 
357 aa  228  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  38.24 
 
 
361 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  38.03 
 
 
361 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  38.03 
 
 
361 aa  225  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  38.03 
 
 
361 aa  225  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  35.49 
 
 
359 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  37.78 
 
 
361 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  37.88 
 
 
358 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  38.06 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  37.75 
 
 
361 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  37.75 
 
 
361 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  40.56 
 
 
358 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0710  peptidase M24  40.71 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  37.22 
 
 
361 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  36.78 
 
 
362 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  39.55 
 
 
369 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  36.07 
 
 
393 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  33.63 
 
 
356 aa  215  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  34.07 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  34.07 
 
 
365 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  33.43 
 
 
358 aa  211  2e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>