More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2684 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  100 
 
 
356 aa  736    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  76.12 
 
 
356 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  60.42 
 
 
356 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  60.73 
 
 
357 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  55.17 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  48.28 
 
 
353 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  36 
 
 
357 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  35.47 
 
 
354 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  37.74 
 
 
372 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  35.03 
 
 
356 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  37.64 
 
 
369 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  35.04 
 
 
363 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  38.82 
 
 
381 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  35.33 
 
 
362 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  34.11 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  38.99 
 
 
347 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  32.56 
 
 
356 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  32.56 
 
 
356 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  32.56 
 
 
356 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  35.61 
 
 
353 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  32.76 
 
 
357 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  32.56 
 
 
356 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  37.15 
 
 
359 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  32.29 
 
 
356 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  33.81 
 
 
354 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  32.56 
 
 
356 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  34.77 
 
 
353 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  32 
 
 
356 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  31.99 
 
 
356 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  31.99 
 
 
356 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  33.24 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  35.34 
 
 
362 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  39.04 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  36.68 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  32.37 
 
 
359 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  31.71 
 
 
356 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  32.95 
 
 
353 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  32.95 
 
 
353 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  36.05 
 
 
348 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  39.07 
 
 
348 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  31.43 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  31.43 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  34.38 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  34.68 
 
 
359 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  31.07 
 
 
357 aa  180  4e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  33.33 
 
 
361 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  29.71 
 
 
356 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  33.71 
 
 
352 aa  176  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  33.33 
 
 
361 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  34.09 
 
 
356 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  33.62 
 
 
361 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  33.05 
 
 
361 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  34.18 
 
 
361 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  33.05 
 
 
361 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  36.67 
 
 
359 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  31.88 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  33.05 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  34.58 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  32.68 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  32.76 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  32.76 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  34.01 
 
 
351 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  33.13 
 
 
346 aa  172  9e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.64 
 
 
357 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  33.06 
 
 
388 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.34 
 
 
366 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  30.06 
 
 
352 aa  169  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  35.39 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  34.76 
 
 
357 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  36.1 
 
 
364 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  36.48 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  31.93 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  38.57 
 
 
363 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  37.25 
 
 
379 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  32.78 
 
 
379 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.25 
 
 
358 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  28.29 
 
 
371 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  34.93 
 
 
355 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  34.66 
 
 
362 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  30.9 
 
 
359 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  30.97 
 
 
357 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  36.69 
 
 
376 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  30.25 
 
 
361 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  31.84 
 
 
369 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  30.08 
 
 
363 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  35.81 
 
 
370 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  32.49 
 
 
358 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0624  peptidase/creatianse family protein  31.45 
 
 
357 aa  157  2e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  32.66 
 
 
352 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  30.14 
 
 
364 aa  157  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  33.73 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  32.29 
 
 
364 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  35.47 
 
 
356 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>