More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1004 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  100 
 
 
357 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  49.86 
 
 
357 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  52.74 
 
 
348 aa  352  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  48.73 
 
 
357 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  46.65 
 
 
356 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  45.58 
 
 
354 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  44.32 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  45.76 
 
 
353 aa  311  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  47.01 
 
 
353 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  44.16 
 
 
353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  42.9 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  42.61 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  44.16 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  43.8 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  45.76 
 
 
359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  42.61 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  42.61 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  43.3 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  43.59 
 
 
353 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  42.05 
 
 
356 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  41.31 
 
 
353 aa  299  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  41.31 
 
 
353 aa  299  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  43.02 
 
 
353 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  42.05 
 
 
356 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  42.05 
 
 
356 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  41.76 
 
 
356 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  41.76 
 
 
356 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  43.3 
 
 
353 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  46.07 
 
 
359 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  40.46 
 
 
353 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  40.51 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  42.25 
 
 
361 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  42.25 
 
 
361 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  42.25 
 
 
361 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  41.76 
 
 
356 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  42.9 
 
 
359 aa  275  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  42.25 
 
 
361 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  41.97 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  42.33 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  41.97 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  46.71 
 
 
364 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  41.71 
 
 
352 aa  272  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  44.38 
 
 
347 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  41.13 
 
 
361 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  41.13 
 
 
361 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  41.19 
 
 
356 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  42.57 
 
 
361 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  41.93 
 
 
367 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  41.41 
 
 
361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  42.61 
 
 
354 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  38.97 
 
 
353 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  41.43 
 
 
354 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  42.69 
 
 
347 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  42.07 
 
 
352 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  37.64 
 
 
362 aa  259  7e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  37.36 
 
 
362 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  45.94 
 
 
363 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  44.66 
 
 
362 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  44.83 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  40.12 
 
 
357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  37.57 
 
 
357 aa  253  3e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  43.06 
 
 
356 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  40.23 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  43.47 
 
 
359 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  37.54 
 
 
363 aa  252  6e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  39.11 
 
 
361 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  45.4 
 
 
365 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  42.9 
 
 
355 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  41.93 
 
 
363 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  43.48 
 
 
358 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  39.83 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  41.01 
 
 
356 aa  246  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  43.03 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  38.53 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  34.54 
 
 
358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  42.94 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  41.94 
 
 
359 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  36.83 
 
 
371 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  36.62 
 
 
360 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  42.25 
 
 
372 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  38.33 
 
 
355 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  37.78 
 
 
364 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  43.18 
 
 
357 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  43.18 
 
 
355 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  38.55 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  42.09 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  42.49 
 
 
376 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  40.35 
 
 
364 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  43.96 
 
 
379 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  45.91 
 
 
372 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  40.36 
 
 
393 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  38.46 
 
 
381 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  42.17 
 
 
396 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3753  peptidase M24  45.7 
 
 
360 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  43.56 
 
 
370 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>