More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1454 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
360 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  39.83 
 
 
357 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  39.56 
 
 
359 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  39.39 
 
 
356 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  39.28 
 
 
357 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  39.38 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  39.38 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  39.66 
 
 
357 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  39.61 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  39.72 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  37.67 
 
 
353 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  38.1 
 
 
371 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  37.53 
 
 
353 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  36.34 
 
 
353 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  36.84 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  37.26 
 
 
353 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  37.26 
 
 
353 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  37.26 
 
 
353 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  39.61 
 
 
354 aa  239  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  37.26 
 
 
353 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  36.19 
 
 
353 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  36.99 
 
 
353 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  36.99 
 
 
353 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  36.71 
 
 
353 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  36.87 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  33.89 
 
 
356 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  36.74 
 
 
353 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  34.26 
 
 
356 aa  235  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  33.89 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  33.89 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  37.4 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  36.36 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  34.44 
 
 
356 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  38.76 
 
 
348 aa  232  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  33.33 
 
 
356 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  38.76 
 
 
347 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  33.89 
 
 
356 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  37.97 
 
 
356 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  35.93 
 
 
352 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  39.02 
 
 
347 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  33.61 
 
 
356 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  36.16 
 
 
362 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  33.43 
 
 
356 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  32.78 
 
 
356 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  35.69 
 
 
363 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  36.24 
 
 
361 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  37.97 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  37.71 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  35.57 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  36.62 
 
 
357 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  35.15 
 
 
354 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  35.41 
 
 
362 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  38.42 
 
 
356 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  33.98 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  34.25 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  34.25 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  34.25 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  34.25 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  34.25 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  33.73 
 
 
355 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  34.72 
 
 
369 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  33.98 
 
 
361 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  32.78 
 
 
357 aa  211  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  35.47 
 
 
359 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  34.34 
 
 
361 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  35.17 
 
 
367 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  34.65 
 
 
348 aa  209  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  35.65 
 
 
359 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  34.07 
 
 
361 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  33.7 
 
 
361 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  35.2 
 
 
359 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  36.8 
 
 
355 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  32.86 
 
 
358 aa  207  3e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  34.57 
 
 
357 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  40.15 
 
 
364 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  36.95 
 
 
355 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  35 
 
 
353 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  37.39 
 
 
352 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  38.15 
 
 
357 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  35.28 
 
 
364 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  33.96 
 
 
356 aa  202  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  31.58 
 
 
381 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  35.93 
 
 
364 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  33.33 
 
 
356 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  35.31 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  35.31 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  35.56 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.33 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  32.51 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  32.23 
 
 
365 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
365 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  35.65 
 
 
376 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
365 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  32.23 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.06 
 
 
365 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  32.88 
 
 
393 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  36.9 
 
 
365 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  33.53 
 
 
355 aa  195  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3149  peptidase M24  34.79 
 
 
370 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  35.67 
 
 
360 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>