More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0922 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  79.85 
 
 
412 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  82.72 
 
 
405 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  100 
 
 
405 aa  843    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  83.21 
 
 
405 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  72.57 
 
 
404 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  73.88 
 
 
403 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  68.03 
 
 
419 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  65.28 
 
 
409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  62.35 
 
 
409 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  59.25 
 
 
401 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  58.81 
 
 
405 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  58.77 
 
 
405 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  60.91 
 
 
420 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  56.22 
 
 
402 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  52.74 
 
 
405 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  43.96 
 
 
414 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  45.39 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  45.39 
 
 
400 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  44.15 
 
 
377 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  40.76 
 
 
453 aa  349  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  42.49 
 
 
435 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  45.39 
 
 
399 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  43.34 
 
 
419 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  42.13 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  43.01 
 
 
380 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  41.07 
 
 
380 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  41.07 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  40.21 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.69 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.69 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  32.96 
 
 
359 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  32.84 
 
 
371 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.11 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  32.89 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  34.15 
 
 
380 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  32.01 
 
 
376 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.88 
 
 
372 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.68 
 
 
365 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  30.14 
 
 
364 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.17 
 
 
378 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.16 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.59 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  34.01 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.32 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  33.24 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  29.72 
 
 
351 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  32.09 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.32 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.59 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  35.57 
 
 
376 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.61 
 
 
351 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.61 
 
 
351 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.04 
 
 
365 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  30.41 
 
 
367 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  34.72 
 
 
369 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  30.85 
 
 
369 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.08 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  33.33 
 
 
374 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  32.78 
 
 
383 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  30.47 
 
 
367 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  33.24 
 
 
375 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  31.18 
 
 
364 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  31.23 
 
 
369 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  31.87 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  33.79 
 
 
386 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  32.76 
 
 
382 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  29.38 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  33.15 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.49 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.49 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  28.93 
 
 
358 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  26.97 
 
 
358 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  31.44 
 
 
361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  26.97 
 
 
358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  30.39 
 
 
397 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  32.97 
 
 
371 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.76 
 
 
357 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  31.52 
 
 
384 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  28.18 
 
 
361 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.25 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  28.49 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  27.45 
 
 
354 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  28.73 
 
 
371 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  40 
 
 
367 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  31.58 
 
 
348 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  33.2 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  28.49 
 
 
353 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  35.24 
 
 
360 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  32.16 
 
 
361 aa  137  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  32.93 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  33.2 
 
 
353 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.8 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.8 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  32.79 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  34.8 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>