More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6520 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  100 
 
 
380 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  69.17 
 
 
380 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  65.79 
 
 
381 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  65.95 
 
 
380 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  63 
 
 
377 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  49.6 
 
 
402 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  44.09 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  47.7 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  47.24 
 
 
409 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  43.8 
 
 
412 aa  329  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  43.47 
 
 
405 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  46.36 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  47.17 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  42.4 
 
 
405 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  43.01 
 
 
405 aa  325  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  42.23 
 
 
409 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  45.74 
 
 
403 aa  322  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  42.46 
 
 
419 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  45.93 
 
 
399 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  46.05 
 
 
400 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  45.79 
 
 
400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  43.34 
 
 
420 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  42.33 
 
 
405 aa  299  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 
453 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  36.87 
 
 
419 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  35.54 
 
 
435 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
414 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  35.64 
 
 
376 aa  193  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  36.44 
 
 
448 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  33.43 
 
 
367 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  36.19 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  34.15 
 
 
376 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  30.94 
 
 
378 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  36.81 
 
 
361 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  33.24 
 
 
371 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  32.49 
 
 
359 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  33.42 
 
 
371 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  34.32 
 
 
380 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  36.14 
 
 
369 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  34.32 
 
 
380 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  31.06 
 
 
365 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.83 
 
 
365 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  34.21 
 
 
376 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.79 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.79 
 
 
365 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  30.79 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  30.79 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.16 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  30.79 
 
 
365 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  30.56 
 
 
365 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  33.33 
 
 
371 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  30.52 
 
 
365 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  34.32 
 
 
380 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  35.31 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  30.11 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  30.21 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  28.81 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  30.52 
 
 
364 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  35.16 
 
 
386 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  30.83 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  30.28 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  34.72 
 
 
366 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  29.01 
 
 
358 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  29.86 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  30 
 
 
336 aa  145  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  32.51 
 
 
374 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  32.94 
 
 
384 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  35.08 
 
 
374 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  29.89 
 
 
373 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  32.94 
 
 
382 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  26.12 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  32.94 
 
 
375 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  28.11 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  29.66 
 
 
351 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  36.15 
 
 
376 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  28.29 
 
 
356 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  29.74 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.21 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.21 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  28.01 
 
 
356 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  27.4 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.9 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.87 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  29.32 
 
 
352 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  33.48 
 
 
356 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  27.7 
 
 
353 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  30.48 
 
 
388 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  32.88 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.37 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  27.32 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  33.24 
 
 
373 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  27.32 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.61 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  31.42 
 
 
353 aa  130  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  27.32 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  27.32 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  29.41 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  27.86 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.07 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>