More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3777 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  100 
 
 
420 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  69.35 
 
 
401 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  62.84 
 
 
403 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  60.5 
 
 
405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  60.5 
 
 
405 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  59.9 
 
 
412 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  60.75 
 
 
405 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  60.1 
 
 
404 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  58.35 
 
 
405 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  61.39 
 
 
409 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  58.91 
 
 
409 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  58.46 
 
 
405 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  57.25 
 
 
419 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  54.61 
 
 
405 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  53.25 
 
 
402 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  48.99 
 
 
399 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  47.24 
 
 
400 aa  350  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  43.38 
 
 
380 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  46.98 
 
 
400 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  43.09 
 
 
380 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  40.44 
 
 
435 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  42.35 
 
 
453 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  43.93 
 
 
414 aa  339  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  43.62 
 
 
377 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  43.62 
 
 
381 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  43.34 
 
 
380 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  42.82 
 
 
419 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  38.24 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  32 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  32 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  30.92 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.2 
 
 
365 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.48 
 
 
365 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.48 
 
 
365 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.48 
 
 
365 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.48 
 
 
365 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.48 
 
 
365 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  32.13 
 
 
376 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.2 
 
 
365 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.2 
 
 
365 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  29.75 
 
 
365 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.2 
 
 
365 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  33.53 
 
 
376 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  34.59 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  31.43 
 
 
371 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  31.73 
 
 
380 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  30.45 
 
 
376 aa  166  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.19 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.2 
 
 
372 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  29.86 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  32.53 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  28.93 
 
 
365 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  29.46 
 
 
364 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.04 
 
 
362 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  31.65 
 
 
359 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  31.11 
 
 
384 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  29.3 
 
 
358 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  31.44 
 
 
383 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  32.07 
 
 
374 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.53 
 
 
357 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  29.3 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.06 
 
 
351 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.06 
 
 
351 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  27.67 
 
 
367 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  30.34 
 
 
378 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.12 
 
 
366 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  32.49 
 
 
361 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  32.34 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.68 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  31.13 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.11 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.11 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.54 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  29.43 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  36.91 
 
 
353 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  36.91 
 
 
353 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  29.48 
 
 
358 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  36.48 
 
 
353 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.52 
 
 
361 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  28.81 
 
 
353 aa  142  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  29.51 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  27.27 
 
 
356 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  26.15 
 
 
353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  27.3 
 
 
351 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  34.73 
 
 
357 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.4 
 
 
382 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  28.53 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  28.61 
 
 
356 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  34.51 
 
 
348 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.69 
 
 
354 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  32.38 
 
 
376 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  28.49 
 
 
356 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  32.5 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>