More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2473 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  100 
 
 		 374 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  65.85 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  65.85 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  65.86 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  65.58 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  66.04 
 
 		 376 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  63.34 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  62.47 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  60.76 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  60.87 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  58.9 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  54.04 
 
 		 361 aa  348  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  53.74 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  54.57 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  57.42 
 
 		 374 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  52.39 
 
 		 386 aa  326  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  52.09 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  54.52 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  45.11 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  42.98 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  44.72 
 
 		 373 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  46.51 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  40.44 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  41.87 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  46.28 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  38.71 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  40 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  38.59 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  38.8 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  39.12 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  40.5 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  31.4 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  35.08 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  33.87 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  32.71 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  38.3 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  32.5 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  32.78 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  41.84 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  36.31 
 
 		 372 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  37.26 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  35.66 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  32.88 
 
 		 369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  35.15 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  35.71 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  35.22 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  32.7 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  33.83 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  34.68 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  33.6 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  34.44 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  33.33 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  34.49 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  29.44 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  32.15 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  32.88 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.42 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.42 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  41.56 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  38.01 
 
 		 348 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  45.66 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  30.39 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  31.69 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  40 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  31.13 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  34.03 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  41.3 
 
 		 361 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  40.43 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  39.57 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  40.43 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  35.02 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  40.43 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  34.83 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  33.52 
 
 		 405 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  33.89 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  37.45 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  31.66 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  37.45 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.85 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.3 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  32.78 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  33.9 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  36.71 
 
 		 353 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  40 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  36.75 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>