More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2258 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  100 
 
 
376 aa  732    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  74.57 
 
 
382 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  65.41 
 
 
380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  65.41 
 
 
380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  65.41 
 
 
380 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  65.41 
 
 
376 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  63.43 
 
 
376 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  63.08 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  60.55 
 
 
383 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  60.87 
 
 
374 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  60.39 
 
 
361 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  60.88 
 
 
369 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  61.58 
 
 
371 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  64.31 
 
 
371 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  59.46 
 
 
386 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  59.12 
 
 
384 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  60.66 
 
 
374 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  57.89 
 
 
373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  44.2 
 
 
373 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  48.35 
 
 
384 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  45.11 
 
 
378 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  46.35 
 
 
373 aa  248  9e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  41.99 
 
 
359 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  44.59 
 
 
397 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  42.36 
 
 
371 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  41.4 
 
 
367 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  44.35 
 
 
373 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  46.3 
 
 
388 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  41.1 
 
 
366 aa  219  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  35.33 
 
 
362 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  38.57 
 
 
366 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  32.69 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  36.12 
 
 
369 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  39.62 
 
 
376 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  36.36 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  36.26 
 
 
366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  36.53 
 
 
402 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  41.83 
 
 
448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  34.6 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  35.57 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  37.18 
 
 
403 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  36.87 
 
 
371 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  31.59 
 
 
357 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  35.07 
 
 
361 aa  193  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  38.16 
 
 
399 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  38.57 
 
 
358 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  35.36 
 
 
404 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  33.85 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  36.41 
 
 
381 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  32.9 
 
 
409 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  34.16 
 
 
419 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  35.48 
 
 
405 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  35.04 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  33.87 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  34.29 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  34.6 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  34.77 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  34.6 
 
 
365 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  34.06 
 
 
365 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  34.6 
 
 
365 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  34.6 
 
 
365 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  34.6 
 
 
365 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  42.13 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  35.75 
 
 
372 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  42.55 
 
 
359 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  31.54 
 
 
369 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  34.33 
 
 
365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  33.7 
 
 
365 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  35.98 
 
 
400 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  32.87 
 
 
405 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  30.34 
 
 
353 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  36.02 
 
 
380 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  31.3 
 
 
351 aa  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  32.6 
 
 
353 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  32.88 
 
 
353 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  36.41 
 
 
414 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  32.23 
 
 
358 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  35.98 
 
 
400 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  40.93 
 
 
357 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  31.96 
 
 
358 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  34.23 
 
 
365 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  31.73 
 
 
453 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  38.96 
 
 
353 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.42 
 
 
353 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  38.55 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  38.55 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  38.55 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  38.55 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  34.09 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  38.55 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  40.25 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  36.93 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  33.63 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  32.89 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  33.63 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  36.31 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  45.98 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  39.77 
 
 
364 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.44 
 
 
356 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  32.54 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>